>Порог является независимым элементом, который устанавливается поверх нижней части коробки, или же сама нижняя часть коробки является порогом? Если первое, то извините, не понял, как коробка может быть выше порога?

Второе.

>или Вы хотели написать "немного выше пола"?

Ну да, пола.

>Поясните, пожалуйста, поподробнее варианты установки коробки. Как они осуществляются?

О том как устанавливаются двери СТАЛ вообще, можно посмотреть в фильме который размещен в первой теме этого форума "Нюансы установки".

Что я могу сказать на счет порога:
Коробка имеет 6 см высоту с одной стороны и 2 см с другой (с которой полотно открывается). Соответственно коробку можно утопить в пол на глубину до двух сантиметров. А можно и не утопить, а поставить вровень с полом или выше него. Выбор того как устанавливать зависит от уровня будущего пола (если делается стяжка), а также от того, сколько нужно оставить зазор сверху. Иногда встречаются бетонные пороги, которые нельзя демонтировать (например, с целью сохранить вторую дверь на том же пороге), тогда коробка ставится поверх этого порога.

Вообще вариантов и тонкостей много, заочно все предусмотреть я не берусь. Если есть возможность вызвать замерщика - воспользуйтесь этим.